Qu'est-ce que la surveillance virologique respiratoire ?
La surveillance virologique respiratoire est menée depuis 2014 par les médecins généralistes et pédiatres Sentinelles en collaboration avec Santé publique France, le Centre National de Référence des infections respiratoires (Institut Pasteur et Hospices civils de Lyon) et l’Université de Corse. Elle a pour objectif principal de décrire, pour chaque saison hivernale, la dynamique spatio-temporelle de l’épidémie de grippe en France métropolitaine.
Ses objectifs secondaires sont les suivants :
- suivre l’évolution de la fréquence des virus respiratoires suivants : SARS-CoV-2, virus respiratoire syncytial (VRS), rhinovirus et métapneumovirus, parmi les cas d’infection respiratoire aigüe (IRA) et de syndromes grippaux vus en consultation de médecine générale et de pédiatrie ambulatoire ;
- caractériser les souches de SARS-CoV-2 et de virus grippaux circulants : typage, sous-typage, caractérisations antigéniques et phylogénétiques, résistance aux antiviraux, et étudier l’adéquation des souches vaccinales au regard des souches virales circulantes ;
- évaluer la part des IRA et des syndromes grippaux vus en consultation de soins primaires dus aux virus grippaux (en fonction du type et sous-type ou du lignage), au SARS-Cov-2, ainsi qu’à d’autres virus respiratoires (VRS, rhinovirus et métapneumovirus) ;
- estimer l’efficacité des vaccins antigrippaux et des vaccins contre l’infection par le SARS-CoV-2 ;
Elle est effectuée par les médecins Sentinelles acceptant d’y participer. Ces médecins réalisent chaque semaine auprès d’un échantillon de cas d’IRA vus en consultation, des recueils salivaires (saison 2021-2022), selon un protocole défini. Durant la saison 2020-2021, cette surveillance a permis non seulement de suivre l'évolution de la pandémie de COVID-19 en France métropolitaine, mais aussi d’objectiver l’absence exceptionnelle de circulation de virus grippaux et la survenue inhabituellement retardée de l’épidémie de VRS. (Voir Bilan annuel 2020).
Vous trouverez une présentation détaillée de cette surveillance en cliquant ici .